昨年10月に触ったときは3.0.0だったOpenLayers 3も、いつの間にか3.5.0になっていたので色々と機能追加や変更があったようです。
特に今回引っ掛かったのはGeoJSONの読み込みで、リリースノートを見ると、ol.source.*(ol.source.GeoJSONなど)が廃止されてol.source.Vectorに統一、formatでこれを指定することになったらしい。
以下、作ってる途中のコードの切れっ端ですが...
3.4.0まで
var smallScalePoints = new ol.layer.Vector({ source: new ol.source.GeoJSON({ url: 'smallScalePoints.json', projection: 'EPSG:3857' }), style: styleFunction, minResolution: 1000, maxResolution: 20000 });
3.5.0以降
var smallScalePoints = new ol.layer.Vector({ source: new ol.source.Vector({ url: 'smallScalePoints.json', format: new ol.format.GeoJSON(), }), style: styleFunction, minResolution: 1000, maxResolution: 20000 });
projectionの指定も必要なくなり、読み込み時にviewのprojectionとソースのprojectionが一致してない場合は変換されるようになったみたい。
参考 : Release v3.5.0 · openlayers/ol3